Cuando la corona es robada del Imperio de Cristal, Twilight Sparkle persigue al ladrón en un mundo alternativo donde ella se transforma en un adolescente que debe sobrevivir a su mayor desafío … el instituto. Con la ayuda de sus nuevos amigos y de sus amigas Applejack de Ponyville, Rarity, Rainbow Dash, Pinkie Pie y Fluttershy, ella se embarca en una búsqueda para encontrar la corona y cambiar el destino de ambos mundos.